วัดคงคาเลียบสร้างเมื่อ พ.ศ. 2441 (ร.ศ.117) เป็นวัดที่สร้างคู่กับกิ่งอำเภอกุแหระเดิม ซึ่งแยกมาจากอำเภอทุ่งสง จังหวัดนครศรีธรรมราช มีเนื้อที่ของวัดเป็น ส.ค.1 พ.ศ.2498 จำนวนเนื้อที่ 49 ไร่ ยาวไปตามลำคลองสินปุน ปัจจุบันมีถนนตัดผ่านเป็นอาณาเขต มีอดีตเจ้าอาวาสมาแล้วจำนวน 4 รูป และเมื่อวันที่ 8 พฤศจิกายน 2551 ได้มีพระครูพิศาลเขตคณารักษ์ (วิรัตน์ ศรีสุขใส) มาดำรงตำแหน่งเจ้าอาวาส ได้ดำเนินการบูรณะปฏิสังขรณ์ จนกระทั่งถึงปัจจุบันนี้
พระครูพิศาลเขตคณารักษ์ ได้มีแผนพัฒนาวัดให้เป็นศูนย์กลางการเรียนรู้คู่กับหมู่บ้านจุฬาภรณ์พัฒนา ให้เป็นวัดในฝันประจำอำเภอทุ่งใหญ่ โดยมีแนวคิดในการพัฒนาที่ว่า "ปั้นดินให้เป็นดาว สร้างดาวให้เป็นบัณฑิต สร้างบัณฑิตให้เป็นมหาบัณฑิต" ควบคู่กับการสร้างศาสนบุคคล ศาสนธรรม ศาสนวัตถุ ศาสนพิธี เป็นต้น
อุโบสถวัดคงคาเลียบที่กำลังก่อสร้าง